nahlédnout do evoluční historii Afrických Pygmejů: změna pohledu
V knize „Afričtí Pygmejové“ (1986), Luigi Luca Cavalli-Sforza recenze výsledky demografické, zdravotní, genetické a antropologické výzkumy zahájené v roce 1966., Podle tohoto učence, Sua (nebo Mbuti) Pygmejové z Ituri forest by být přímo pocházející z předků většina—pokud ne všechny—Trpasličí skupin, vzhledem k tomu, že Aka ze středoafrické Republiky by prošly vysokou úroveň genetické příměsi s Non-Trpasličí soused populace. Podle těchto výsledků a zároveň je schopen poskytnout formální důkazy, Cavalli-Sforza podporoval hypotézu společného Trpasličího původu, s následnou diverzifikaci, na rozdíl od teorie Hiernaux (1974) nezávislé úpravy prostředí deštného pralesa.,
Více než patnáct let po vydání „Afričtí Pygmejové“, genetických příměsí vzor původně našel v Pygmejové Aka byla dále analyzována pomocí sex-specifických genetických markerů (mitochondriální DNA a Y-chromozomální polymorfismy) a podpisy sex-neobjektivní genetických příměsí mezi Aka Trpaslík skupin a Non-Pygmejové byly detekovány Destro-Bisol et al. (2004b), po dohodě s etnografickým původem sex-zaujatých manželských režimů., Stejný výzkumný tým dále hypotetický společný původ všech Trpasličí populace, a navrhl, na základě simulační přístupy a fylogenetické závěry, že první oddělení mezi předky Trpasličí a Non-Trpasličí populace došlo mezi 60,000 a před 30 000 lety a navrhl více nedávné divergence mezi dva Trpasličí skupiny populace nyní žije v podélné extrémy Střední Africe s děleným vyskytující se před 18 000 lety (Destro-Bisol et al. 2004a; Batini et al. 2007)., Tyto odhady byly později potvrzeny fylogenetický přístup pomocí mitochondriální DNA sekvencí na širší populaci set (Quintana-Murci et al. 2008). Tyto studie však nebylo formálně zkoušky společné nebo nezávislé původu středoafrické Pygmeje pomocí modelu založeného přístupu, protože jsou považovány za velmi omezený počet Trpasličí populace a/nebo pouze dva non-rekombinace sex specifických lokusů. Tato omezení byla od té doby překonána.,
ve skutečnosti, počínaje rokem 2009, základní zálohy o rekonstrukci historie a rozmanitost středoafrické obyvatelstvo bylo dosaženo díky vysokému rozlišení vzorků populace získaných interdisciplinárních týmů biologické a kulturní antropologové. V této souvislosti, strategie výběru populace Verdu et al. (2009) těžil z mnoha kulturních kritérií navržených kulturními antropology (např. Bahuchet 1992; Hewlett 1996; Joiris 2003). Verdu et al., (2009) shromáždila více než šest set vzorků DNA od 9 Trpasličí populace žijící v Kamerunu a Gabonu a od 12 Non-Trpasličí sousedních populací, se kterými Pygmejové udržovat úzké sociálně-ekonomických interakcí. Jejich analýza umožnila i) kvantifikace míry autosomálně neutrální genetické rozmanitosti v Západní středoafrické obyvatelstvo, ii) šetření komplexu Trpasličí/Non-Trpasličí kategorizace z genetického hlediska a iii) formální zkoušku společné nebo nezávislé původu četné Západní Centrální Africké Trpasličí populace prostřednictvím modelu založeného přístupu.,
Daleko od bytí geneticky homogenní skupinu populace, genetické rozmanitosti Západní Centrální Afričané se vysvětluje hlavně tím, že značné genetické vzdálenosti mezi jednotlivými dvojicemi Trpasličí populace, Non-Trpasličí populace, často je výrazně geneticky odlišné od sebe navzájem (Obr. 1). Tato biologická rozmanitost odráží velkou kulturní rozmanitosti pozorované v populaci vzorku a dále zpochybnil společný původ dopravena pomocí deka termín Pygmej.,
Metric multidimensional scaling (MDS) pozemek na základě párového populace genetické odlišnosti (FST, Weir and Cockerham 1984), které se vypočítají pomocí 28 autosomálně tetranucleotide mikrosatelitů markerů genotyp v 9 Trpasličí a 12 Non-Trpasličí sousedních populací (FST matice dříve publikované v Verdu et al. (2009)). Nevýznamné hodnoty FST založené na permutačních testech byly nastaveny na 0 před výpočtem metrických MDS (Verdu et al., 2009). Posoudit, jak přesně dvourozměrné MDS plot zastoupeny párového populace genetické odlišnosti, vypočítáme Spearmanův korelační mezi Euclidian vzdálenosti mezi dvojicemi populací na MDS plot a odpovídající hodnoty párového FST genetické. Získali jsme Rho Spearmana rovného 0,84 (p-hodnota < 10-5). Dále jsme zjistili, že Euclidian vypočítá vzdálenost mezi dvěma populacemi na MD pozemku za předpokladu, že odpovídající FST hodnotu plus nebo minus 0.004 v průměru.,
Trpasličí populace jsou označené v černé následovně: BEZ = Bezan, centrální Kamerun; CBK = Baka, centrální-východní Kamerun; EBG = Bongo, Gabon východní; EBK = Baka, jihovýchodní Kamerun; GBK = Baka, severní Gabon; KOL = Kola, západní Kamerun; KOY = Koya, severovýchodní Gabon; SBG = Bongo, Gabon jižní; SBK = Baka, jižní Kamerun., Non-Trpasličí populace jsou označeny šedou barvou takto: AKL = Akele, východní Gabon (Bongomo); BGD = Bangando, jihovýchodní Kamerun; CFG = Fang, jižní Kamerun; EWD = Ewondo, centrální Kamerun; GFG = Fang, severní Gabon; KOT = Kota, centrální Gabon; NGB = Ngumba, západní Kamerun; NZE = Nzebi, jihovýchodní Gabon; NZI = Nzime, centrální-východní Kamerun; TEK = Teke, východní Gabon; TIK = Tikar, centrální Kamerun; ZTS = Tsogho, centrální Gabonu.,
jazykové příslušnosti vzorků je založen především na (Greenberg 1966; Guthrie 1967), zní takto: Adamawa-Ubanguian rodina = (▲); Bantoid Non-rodiny Bantu = (+); Bantu rodina: A. 70 = (▽); A. 80 = (●); B. 20 = (■); B. 30 = (); B. 30 B. 50 = (); B. 50 = (); B. 70 = (◆).
Zajímavé je, že jazykovou rozmanitost Western Central African Pygmy a Non-Trpasličí populace ani předpovědět genetické vzdálenosti počítány mezi dvojicemi populací a Non-Trpasličí sousedy., Při mluvení úzce související jazyky, mohou být geneticky velmi daleko od sebe (např. Pygmejové Baka a Bangando Non-Pygmejové, viz obrázek 1). Odlišně, Non-Pygmy populace mluvící jazyky patřící do různých jazykových rodin mají malé, často nevýznamné, genetické vzdálenosti (viz obrázek 1).
kromě toho měla každá Pygmejská populace různé úrovně genetické příměsi se svými Nepygmy sousedy (Patin et al. 2009; Tishkoff et al. 2009; Verdu et al. 2009)., Tyto heterogenní úrovně asymetrický tok genů z Non-Pygmejové do Pygmejové byla nalezena nepřímo úměrná síle socio-kulturní bariéry, které brání sňatků mezi každé konkrétní dvojice sousedních obcí (Verdu et al. 2009). Tyto výsledky ilustrují, jak rozmanitost genetické vzory v celé Trpasličí populace jsou určovány specifickými sociálně-kulturními faktory, a ukázat, jak popis biologické rozmanitosti středoafrické Pygmeje může být neobjektivní, když se jen několik skupin, jsou analyzovány.,
K hledání genetické stanovení diferenciální postavení mezi Pygmeji a Non-Pygmejové, práce Becker et al. (2011) je velmi slibná. Ukázali, že Pygmy jedinci, kteří jsou více smísí s non-Pygmy sousedy jsou také pravděpodobně vyšší. Tím, že analyzuje vzorky genetických příměsí v několika Západní Centrální Africké Trpasličí populace, se prokázala, i když nepřímo, že diferenciální postavy fenotyp pozorován mezi Pygmeji a Non-Pygmejové měli genetický základ.,
nakonec pomocí autozomálních mikrosatelitů v celém genomu a přibližných Bayesovských výpočetních metod (ABC) (Beaumont et al. 2002; Cornuet et al. 2008), Verdu et al. (2009) poprvé formálně testováno, zda četné Západní Středoafrické Pygmy populace sdílely společný nebo nezávislý původ, a odhadovaly časy divergence mezi populacemi., Navzdory široké genetické diferenciace mezi Západní středoafrické Pygmeje, nejpravděpodobnější scénář se zdá být, že z velmi nedávné rozdělení Západní středoafrické Pygmeje, asi před 3000 lety, z rodové Trpasličí populace, která se liší od Non-Trpasličí linie 50.000 až 90.000 let (Verdu et al. 2009). Tento odhad překrývá předchozí odhad založený na simulačních a fylogenetických přístupech Destro-Bisol (2004a; 2004b), Batini et al. (2007) a Quintana-Murci et al. (2008).,
podobný model-based metoda byla později rozšířena na další Centrální Africké Trpasličí skupiny, zejména na Východě, pomocí neutrální autosomálně sekvence (Patinu et al. 2009) a mitochondriální DNA (Batini et al. 2011). Výsledky ukázaly, že Východní a Západní Centrální Africké Trpasličí populace, dnes žije několik tisíc kilometrů od sebe, pravděpodobně sdílí společný původ, přibližně 20 000 lety, zatímco divergence mezi předků Trpasličí a Non-Trpasličí populace došlo kolem 70.000 lety., Oba odhady ukazují intervaly spolehlivosti, které jsou v souladu s předchozími studiemi na základě simulace, fylogenetické a model-based přístupy (Destro-Bisol et al. 2004a, b, Batini et al. 2007, Quintana-Murci et al. 2008, Verdu et al. 2009).
studie jsme se zmínili zatím řešit rozmanitost středoafrické populace v rámci komplexní kulturní kategorizace Trpasličí/Non-Trpasličí a vrhnout světlo na všeobecně neznámý evoluční a adaptační historie středoafrické populace., Rádi bychom zde zdůraznili, že tento výzkum byl umožněn pouze kvalifikovanou spoluprací mezi biology, sociálními antropology a lingvisty. Budoucí multidisciplinární práce umožní pečlivé rekonstrukci historie příměsí mezi Pygmeji a Non-Pygmejové, jako nevíme, kdy a jak dynamický sňatků mezi Pygmeji a Non-Pygmejové se vyvinul v průběhu dějin., Konkrétně jsme chtěli posoudit, zda genetických příměsí vzory se změnily v průběhu předkoloniální, koloniální a post-koloniální časy, aby se pochopit, jak změny míry toku genů může mít vliv na biologické a genetické adaptace procesů těchto populací.