タンパク質の構成要素は、アミノ酸であり、アミノ基、カルボキシル基、水素原子、側鎖と呼ばれる可変成分からなる小さな有機分子である。 蛋白質の中では、多数のアミノ酸はそれにより長い鎖を形作るペプチド結束によって一緒につながります。, ペプチド結合は、あるアミノ酸のアミノ基を隣接するアミノ酸のカルボキシル基に結合するときに水分子を抽出する生化学的反応によって形成さ タンパク質内のアミノ酸の線形配列は、タンパク質の一次構造と考えられています。
タンパク質は、ユニークな側鎖を有するそれぞれが唯一の二十アミノ酸のセットから構築されています。 アミノ酸の側鎖は異なる化学的性質を有する。 アミノ酸の最大のグループは、非極性側鎖を有する。, 他のいくつかのアミノ酸は、正または負の電荷を有する側鎖を有し、他のアミノ酸は極性であるが非荷電の側鎖を有する。 アミノ酸の側鎖の化学はある特定の形または立体配座の蛋白質の長さを握るためにこれらの側鎖が互いに結ぶことができるので蛋白質の構造 荷電アミノ酸側鎖はイオン結合を形成することができ、極性アミノ酸は水素結合を形成することができる。 疎水性側鎖は弱いファンデルワールス相互作用を介して相互に相互作用する。 これらの側鎖によって形成される結合の大部分は非共有価である。, 実際、システインは共有結合を形成することができる唯一のアミノ酸であり、それらはそれらの特定の側鎖と共に行う。 側鎖相互作用のために、特定のタンパク質中のアミノ酸の配列と位置は、そのタンパク質の曲がりや折り目がどこで起こるかを導きます（図1）。,
図1：アミノ酸側鎖とタンパク質配座の関係
アミノ酸の側鎖は（上で、青い円;下で、すべての着色された円）です。 一連のペプチド結束によって一緒に接続されたとき、アミノ酸はポリペプチド、蛋白質のための別の単語を形作る。, その後、ポリペプチドは、そのアミノ酸側鎖間の相互作用（破線）に応じて特定の立体配座に折り畳まれる。
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