Rolle bei der Erhaltung und Erhaltung
Bereits 1876 forderte Muir die Bundesregierung auf, eine Waldschutzpolitik zu verabschieden. Er wurde zu einer zentralen Figur in der Debatte über die Landnutzung und setzte sich im Namen des Landschutzes vor allem durch Artikel ein, die in populären Zeitschriften wie Atlantic Monthly, The Century Magazine und Harpers New Monthly Magazine (jetzt Harper ‚ s Magazine) veröffentlicht wurden. Obwohl zunächst eine gemeinsame Basis in den Ideen des Waldschutzes von Gifford Pinchot, einem Pionier der USA, gefunden wurde., forstwirtschaft und Naturschutz, Muirs Ansichten gingen letztendlich auseinander. Während Pinchot die nachhaltige Nutzung der Ressourcen innerhalb der nationalen Wälder unterstützte, vertrat Muir die Auffassung, dass Nationalparks und Wälder in ihrer Gesamtheit erhalten bleiben sollten, was bedeutet, dass ihre Ressourcen für industrielle Interessen tabu sein sollten. Obwohl die Nationalparks Sequoia und Yosemite 1890 gegründet wurden und einen Sieg für den Umweltschutz darstellten, war die Debatte zwischen Pinchots utilitaristischem Ansatz für die Forstwirtschaft und Muirs Konservierungsansatz noch lange nicht vorbei.,Mai 1892 gründete Muir den Sierra Club, eine Organisation, die sich dem Schutz der Umwelt widmete. Er diente als erster Präsident, eine Position, die er bis zu seinem Tod in 1914 innehatte. Das Sierra Club Bulletin, eine Veröffentlichung für die Mitglieder der Organisation, bot Muir einen wichtigen Zugang und ermöglichte es ihm durch sein Schreiben, das Bewusstsein für Umweltfragen zu schärfen.
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Anfang 1897 benannte US-Präsident Grover Cleveland 13 nationale Wälder, die vor kommerzieller Ausbeutung bewahrt werden sollten. Geschäftsinteressen veranlassten den Kongress jedoch, die Wirkung dieser Maßnahme zu verschieben., Muirs Schriften erwiesen sich letztendlich als einflussreich in der öffentlichen Meinung sowie in der Kongressmeinung zugunsten nationaler Waldreservate. Muir beeinflusste das groß angelegte Naturschutzprogramm, das von Präsident Theodore Roosevelt initiiert wurde, der Muir 1903 auf einem Campingausflug in die Yosemite-Region begleitete. Im Jahr 1908 gründete die Regierung Muir Woods National Monument in Marin County, Kalifornien, und 1964 bezeichnete es sein Haus in Martinez, Kalifornien, als nationale historische Stätte., Muirs Arbeit war auch einflussreich bei der Gründung des Mount Rainier National Park (1899) im Bundesstaat Washington und des Grand Canyon National Park (1919) in Arizona.
