Po śmierci ich ojca, cesarza Huayna Capaca, i ich starszego brata, Ninan Cuyochi, który był dziedzicem, imperium zostało podzielone między dwóch ocalałych braci, Huáscar i Atahualpa. Huascar otrzymał większą część ze stolicą Cusco, a Atahualpa części Północne, w tym Quito (obecnie stolica Ekwadoru). Przez kilka lat obaj bracia panowali bez problemów. Jednak Huascar zażądał, aby Atahuallpa złożył mu przysięgę. Atahuallpa odmówił i rozpoczęła się wojna domowa.,
ostatnia bitwa miała miejsce w Quipaipan, gdzie Huascar został pojmany. Atahuallpa odpoczywał w mieście Cajamarca w Andach ze swoją armią liczącą 80 000 żołnierzy w drodze na południe i Cusco, aby zdobyć tron.
w tym czasie hiszpański konkwistador Francisco Pizarro założył miasto Piura, pierwszą hiszpańską osadę w Peru w lipcu 1532 roku., Po dwóch miesiącach marszu Pizarro przybył do Cajamarca z zaledwie 168 ludźmi pod jego dowództwem i wysłał Hernando de Soto, zakonnika Vicente de Valverde i rodzimego tłumacza Felipillo, aby porozmawiali z Atahuallpa o hiszpańskiej obecności.
do Pizarro powrócili wysłannicy hiszpańscy, którzy przygotowali niespodziewany atak na armię Atahuallpy w bitwie pod Cajamarca 16 listopada 1532 roku.
zgodnie z hiszpańskim prawem Hiszpanie oficjalnie wypowiedzieli wojnę Inkom., Kiedy Atahuallpa chłodno zapytał kapłana Valverde z jakiego autorytetu on i jego ludzie mogą mówić takie rzeczy, Valverde zaoferował mu Biblię, mówiąc, że autorytet pochodzi od słów w nim. Zbadał go i zapytał, dlaczego nie przemówił do niego. Następnie rzucił go na ziemię. To dało Hiszpanom pretekst do wojny z Inkami. Otworzyli ogień, a w ciągu dwóch godzin zginęło ponad dwa tysiące żołnierzy Inków. Następnie Hiszpanie uwięzili Atahuallpa w Świątyni Słońca.,
Hiszpanie wykonujący Tupaca Amaru w 1572 roku, rysunek Guamana Poma de Ayala
Atahuallpa nadal nie mógł uwierzyć, że Hiszpanie zamierzali przejąć kontrolę nad jego królestwem. Myślał, że jeśli da im złoto i srebro, których szukali, odejdą. W zamian za uwolnienie zgodził się wypełnić duży pokój złotem i obiecał Hiszpanom dwukrotnie tę kwotę w srebrze., Chociaż był oszołomiony ofertą, Pizarro nie miał zamiaru uwolnić Inków, ponieważ potrzebował wpływów władcy nad tubylcami, aby utrzymać porządek w otaczającym kraju.
Ale wtedy Pizarro zdecydował się na jego egzekucję, ponieważ obawiał się, że może zostać uwolniony przez generała Inków. Pizarro upozorował pozorowany proces i uznał Atahuallpa winnym buntu przeciwko Hiszpanom i zamordowania Huáscara, własnego brata. Atahuallpa został skazany na egzekucję przez spalenie., Był przerażony, ponieważ Inkowie wierzyli, że dusza nie będzie w stanie przejść do życia pozagrobowego, jeśli ciało zostanie spalone. Brat Vicente de Valverde, który wcześniej ofiarował Biblię Atahuallpie, interweniował ponownie, mówiąc Atahuallpie, że jeśli zgodzi się na nawrócenie na chrześcijaństwo, przekona resztę do złagodzenia wyroku. Atahualpa zgodził się przyjąć chrzest w wiarę chrześcijańską. Otrzymał imię Juan Santos Atahualpa, a następnie został uduszony garotą zamiast zostać spalony. Atahuallpa zmarł 29 sierpnia 1533 roku.,Atahuallpa został zastąpiony przez swojego brata, marionetkowego Inka Tupaca Huallpa, a później przez innego brata Manco Inca Yupanqui.
