koszt testów jest często barierą nie do pokonania: firmy ubezpieczeniowe w USA nie zwracają za nie rutynowo, ponieważ, jak mówią, wyniki nie zmieniają opieki nad autyzmem., „jest bardzo zmienna w zależności od prowadzonej polityki, firmy i czasu, jaki mogę spędzić, rozmawiając z osobą, która czyta mi ekran komputera przez telefon”, mówi Joseph Cubells, profesor nadzwyczajny Genetyki Człowieka i psychiatrii na Uniwersytecie Emory w Atlancie w stanie Georgia. „Jest to bardzo ograniczone i frustrujące.”
rutynowe testy microarray oszczędziłyby Calleen Kenney lat zmartwień i winy, gdyby były dostępne, gdy jej córka Maia urodziła się 20 lat temu., Kiedy Maia miała 2 lata, lekarze przebadali ją pod kątem kilku znanych chorób związanych z autyzmem, w tym kruchego zespołu X i Angelmana. Kenney zinterpretował negatywne wyniki w ten sposób, że stan Mai nie był genetyczny. Nawet kiedy lekarze zauważyli, że Maia ma wyraźne rysy twarzy, które sygnalizują chorobę genetyczną, Kenney myślał, że po prostu krytykują wygląd jej córki. Kiedy rok później zdiagnozowano u Mai autyzm, Kenney zaczął kwestionować wszystko, co zrobiła, od szczepienia Mai po rzeczy, które jadła, gdy była w ciąży.,
dopiero w październiku, kiedy Maia w końcu poddała analizie chromosomalną mikroarray, Kenney dowiedziała się, że jej córka ma delecję regionu genetycznego o nazwie 22q13. Delecja prowadzi do zespołu Phelana-Mcdermida, na który Maia nigdy nie była badana. Zespół, któremu często towarzyszy autyzm, może wpływać na nerki i oczy, a Kenney natychmiast pomyślał o bieżących problemach Maii z oddawaniem moczu i zablokowanymi kanałami łzowymi; od tego czasu zorganizowała regularne sprawdzanie nerek i oczu Maii.
Kenney przestała się obwiniać i próbowała zmienić córkę., Maia z czasem staje się coraz bardziej niespokojna i przerażona robieniem czegokolwiek na własną rękę. Przed testem Kenney próbował nauczyć Maię większej niezależności, co tylko sprawiło, że Maia była bardziej niespokojna i wściekła. Ale teraz, uznając, że Maia jest taka, jaka jest z powodu biologii, Kenney zatrudnił dodatkowych opiekunów, aby upewnić się, że Maia zawsze ma pomoc.
„zamiast próbować zmienić jej zachowania, modyfikujemy sposób, w jaki o nią dbamy” – mówi Kenney. „To dało mi dużo ulgi wiedząc, skąd pochodzi jej autyzm, i że nie było nic, co mógłbym zrobić inaczej.,”
Gen po Genie:
stan Maia jest jednym z niewielu związanych z autyzmem, które są spowodowane dużymi mutacjami chromosomalnymi. W wielu innych przypadkach mutacja zakłóca pojedynczy gen—a według najnowszych szacunków mogą być ich setki. Ale panele genowe wielu komercyjnych laboratoriów używać zawierają kilka genów z tej listy, zamiast faworyzowania tych związanych ze znanymi zespołami. Jedno z badań w zeszłym roku wykazało, że listy genów z 21 firm mają tylko jeden gen wspólny; tylko 12 zawiera CHD8, często cytowany jako gen główny autyzmu.,
„nie ma jasnych kryteriów przypisywania genu do listy autyzmu, większość firm nie zapewnia uzasadnienia dla włączenia”, mówi współprowadzący badacz Ny Hoang, doradca genetyczny w szpitalu dla chorych dzieci w Toronto, Kanada. Hoang i jej współpracownicy są częścią międzynarodowej grupy roboczej tworzącej listę genów, które mają silne powiązania kliniczne z autyzmem. Mają one na celu upublicznienie listy i zestawu wytycznych oraz ich regularną aktualizację.,
ostatecznie testy genetyczne mogą obejmować sekwencjonowanie całych genomów ludzi: wstępne prace przedstawione na konferencji genetycznej w październiku sugerują, że byłaby to najbardziej skuteczna metoda pierwszego rzutu, ponieważ wykrywałaby wszystkie informacje z każdego rodzaju testu genetycznego. W międzyczasie niektóre zaawansowane Ośrodki, w tym laboratoria badawcze, mają dostęp do narzędzi, które mogą sekwencjonować egzom—zbiór wszystkich segmentów kodujących białka w genomie. Ta metoda jest kosztowna, a długa lista wyników, które generuje, może utrudnić identyfikację mutacji odpowiedzialnej., Ale może również ujawnić nieoczekiwane mutacje.
Carbone musiał dwukrotnie zażądać uporządkowania exome Jamesa—zajęło to dwa lata, zanim firma ubezpieczeniowa się na to zgodziła. W lipcu, na miesiąc przed wynikami, 15-letni James przeszedł operację rekonstrukcji otworu w zatokach. Po zabiegu został wypisany i odesłany do domu. Ale potem zaczął krwawić. Zemdlał z powodu utraty krwi, a Angela trzymała go prosto, co wywołało drgawki. Kiedy się obudził, przerażony, James walczył z sanitariuszami, którzy próbowali zabrać go z powrotem do szpitala.,
miesiąc później Sekwencja exome ujawniła, że James ma dwie kluczowe mutacje: jedną w TAF1, co tłumaczy jego autyzm i opóźnienie rozwoju; i jedną w genie GP9, który powoduje niską liczbę płytek krwi i doprowadził do powikłań po operacji.
poza korzyściami dla jednostki, sekwencjonowanie egzomów może być jedynym sposobem, w jaki naukowcy mogą odkryć pełną listę mutacji związanych z autyzmem. Mając ten cel na uwadze, zespół Johna Constantino oferuje sekwencjonowanie exome każdemu, kto odwiedza klinikę autyzmu na Uniwersytecie Waszyngtona w St. Louis, Missouri., Zespół testuje każdą osobę z microarray najpierw, a następnie sprawia, że sprawa dla sekwencjonowania exome kwalifikować się do zwrotu kosztów ubezpieczenia. Współpracują z laboratorium komercyjnym, które negocjuje zwroty i wykorzystuje prywatną dotację, aby wchłonąć wszystko, czego nie obejmuje ubezpieczenie. „To jedna z tych absurdalnych tragedii niesystematycznego systemu opieki zdrowotnej, z którą mamy do czynienia; to jak wymiana czy coś”, mówi Constantino.,
Constantino i jego współpracownicy zidentyfikowali warianty genetyczne predysponujące osoby autystyczne do podtypów padaczki, które reagują na określone leki. Wyniki zmieniły również leczenie niektórych osób autystycznych w oparciu o doniesienia o przypadkach innych z tą samą mutacją. I w jednym przypadku, zespół znalazł mutację związaną z autyzmem u nierozpoznanego dziecka. Dziecko przejawiało agresywne zachowania w miejscach publicznych i zostało odebrane rodzicom przez opiekę nad dziećmi; po diagnozie został zjednoczony z rodziną.,
Grupa Ledbettera w Geisinger oferuje również badania genetyczne dla każdej osoby z autyzmem lub opóźnieniem rozwojowym. Udało im się przekonać ich partnerską firmę ubezpieczeniową, że sekwencjonowanie exome powinno być testem pierwszego rzutu, ponieważ może wykryć Duże mutacje normalnie identyfikowane tylko przez mikrourazy.
obie te grupy prowadzą niezależne listy mutacji i powiązanych z nimi efektów klinicznych. Przeciętny klinicysta może jednak nie być świadomy tych zasobów lub wiedzieć, jak je zastosować.,
istnieje kilka baz danych dostępnych dla każdego klinicysty, który musi sprawdzić znaczenie danej mutacji. ClinVar i ClinGen, finansowane przez National Institutes of Health, wymieniają geny i specyficzne warianty znalezione u osób ze znanymi warunkami. ClinGen, na przykład, wymienia 40 genów z 'definitywnym' powiązaniem z autyzmem. Organizacje zawodowe doradzają klinikom przeszukiwanie zarówno ClinVar, jak i ClinGen, a także dużych baz danych kontroli. Zalecają również ocenę, czy mutacja może zakłócić powiązane białko., Wynikiem jest ogólny wynik „patogenny”, „prawdopodobny patogenny”, „znaczenie niepewne”, „prawdopodobny łagodny” lub ” łagodny.”
Ten system klasyfikacji jest próbą standaryzacji sposobu, w jaki laboratoria łączą geny i warianty ze schorzeniem, mówi Christa Lese Martin, dyrektor Instytutu autyzmu i medycyny rozwojowej w Geisinger. Wiele laboratoriów rutynowo analizuje wszystkie sekwencje w swojej bazie danych każdego roku, aby szukać nieznanych wcześniej linków. Geisinger utrzymuje również „listę obserwacyjną” genu: na przykład w ubiegłym roku zmodernizowali Gen DLG4 z „niepewnego” do „patogennego”, mówi Martin., „Dzięki większej ilości danych wiele się nauczyliśmy.”
pracownicy Geisinger oferują sekwencjonowanie exome każdemu, kto odwiedza ich klinikę zdrowia i przebadał do tej pory ponad 100 000 osób. Z początkowej grupy 60 000 osób zidentyfikowali 35, którzy mają delecję w segmencie chromosomalnym zwanym 16p11. 2, co jest związane zarówno z autyzmem, jak i otyłością. Wszystkie 35 mają nadwagę lub otyłość, ale wczesne informacje o mutacji mogły uniemożliwić ten wynik.
dla wielu osób autystycznych i ich rodzin informacje te oferują również potężną ulgę w trwającej całe życie niepewności.,
„to przeobrażające osobiste doświadczenie dla tych ludzi, którzy mieli problemy z nauką, zmagali się w szkole i nigdy nie zrozumieli, dlaczego; ich rodzice i nauczyciele myśleli, że są leniwi i nie starają się mocno; ich rodzice i nauczyciele nie wierzyli, że mają zaburzenia lękowe; mieli to, co uważali za niezwiązane z fizycznymi problemami medycznymi”, mówi Ledbetter. „Uważamy, że byłoby znacznie lepiej dla ludzi, aby dowiedzieć się o tym we wczesnym dzieciństwie.”
odkąd James otrzymał odpowiednie leczenie z powodu krwawienia, nie miał ani jednego krwawienia z nosa., Gdyby lekarze dowiedzieli się wcześniej o jego stanie, mogli oszczędzić Jamesowi urazu, który został przewieziony do szpitala karetką po operacji zatok. James uśmiechał się i wskazywał podniecająco, gdy zobaczył karetki i wozy strażackie, ale teraz krzyczy: „nie ma karetki!”I” No fire truck!”Zabranie go do szpitala nawet na rutynowe wizyty stało się wyzwaniem.
dla Angeli wyniki genetyczne zakończyły lata oczekiwania., Mówi, że niektóre z tego, czego dowiedziała się o skutkach mutacji taf1, są otrzeźwiające, ale przynajmniej w końcu zna korzenie warunków Jamesa i może planować przyszłość. „Jest żal, jest wreszcie akceptacja” „Jestem wdzięczny, że wiem.,”
Czytaj dalej
- badanie wzmacnia ciekawy związek autyzmu z wariancją płci
- docieranie do rodzin może zainspirować nowe badania autyzmu
- testy genetyczne na autyzm
- Spectrum Stories: Tapping intelligence in minimally werbal people with autyzm
Ta historia została pierwotnie opublikowana na Spectrum.
