Elnökség
Szaddám 1979-ben nyílt ellenőrzést kezdett gyakorolni a kormány felett, és Bakr lemondása után elnök lett. Ezután a Forradalmi Parancsnoki Tanács elnöke lett, és többek között a miniszterelnök is. Kiterjedt titkosrendőrséget használt, hogy elnyomja az uralmának bármilyen belső ellenállását, és kiterjedt személyi kultusz tárgyává tette magát az iraki közvélemény körében., Elnöki célja az volt, hogy Egyiptomot az Arab világ vezetőjévé tegye, és hegemóniát érjen el a Perzsa-öböl felett.
Szaddám 1980 szeptemberében inváziót indított Irán olajmezőire, de a kampány a lemorzsolódás háborújában lerobbant. A háború költségei és az iraki olajexport megszakítása miatt Szaddám leépítette ambiciózus Gazdaságfejlesztési programjait., Az Irán-Irak háború 1988-ig patthelyzetben zajlott, amikor mindkét ország elfogadta a harcok véget ért tűzszünetet. Annak ellenére, hogy a nagy külföldi adósság, amellyel Irak találta magát Nyerges háború végén, Szaddám továbbra is építeni a fegyveres erők.
1990 augusztusában az iraki hadsereg legyőzte a szomszédos Kuvaitot., Szaddám nyilvánvalóan az ország hatalmas olajbevételeit akarta felhasználni Irak gazdaságának megerősítésére, de Kuvait elfoglalása gyorsan globális kereskedelmi embargót váltott ki Irak ellen. Tudomást sem vett a fellebbezés visszavonására az erők kuvaitból, annak ellenére, hogy az építmény a nagy USA által vezetett katonai erő, Szaúd-Arábia, valamint a folyosón, az Egyesült Nemzetek szervezete (ENSZ) állásfoglalásokat, hogy elítéli a szakma, valamint felhatalmazza az erőszak vége. A Perzsa-öböl háborúja 1991.január 16-án kezdődött, és hat héttel később ért véget, amikor a szövetséges katonai koalíció kiűzte Irak seregeit Kuvaitból., Irak elsöprő veresége a síiták és a kurdok belső lázadását váltotta ki, de Szaddám elnyomta felkeléseiket, ezrek menekültek menekülttáborokba az ország északi határa mentén. Több ezer embert öltek meg, sokan egyszerűen eltűntek a rezsim börtöneiben.
Az ENSZ-szel kötött tűzszüneti megállapodás részeként Iraknak megtiltották vegyi, biológiai és nukleáris fegyverek előállítását vagy birtoklását. Számos szankciót szabtak ki az országra a betartásig, amelyek súlyos gazdasági zavarokat okoztak., Szaddám továbbra sem hajlandó együttműködni az ENSZ fegyverellenőreivel, ezért 1998 végén az Egyesült Államok és Nagy-Britannia négynapos légicsapást hajtott végre (Desert Fox hadművelet). Mindkét ország bejelentette, hogy támogatja azon erőfeszítéseket, amelyek az Iraki ellenzék, hogy leváltson Szaddam, akinek a rezsim nőtt egyre brutális alatt ENSZ-szankciókat, de az Iraki vezető tiltva ENSZ-fegyverek az ellenőrök, hogy belépjenek az országba. Közben világossá vált, hogy Szaddám az egyik fiát—Uday vagy Qusay—ápolja, hogy utódja legyen. Mindketten magas rangú pozíciókba kerültek, és mindketten tükrözték apjuk brutalitását., Ráadásul Szaddám továbbra is megszilárdította hatalmát otthon, miközben retorikájában mélyen dacos és Amerika-ellenes álláspontot képviselt. Bár otthon egyre inkább féltek, Szaddámot az Arab világban sokan úgy tekintették, mint az egyetlen regionális vezetőt, aki hajlandó szembeszállni az amerikai agresszióval.
az Egyesült Államokban 2001.szeptember 11-i támadások nyomán az Egyesült Államok kormánya, kijelentve, hogy Saddam vegyi vagy biológiai fegyvereket nyújthat a terrorista csoportoknak, megpróbálta megújítani a leszerelési folyamatot. Bár Szaddám 2002 novemberében engedélyezte az ENSZ fegyverellenőreinek, hogy visszatérjenek Irakba, az Egyesült Államok és Nagy-Britannia vizsgálataival való teljes körű együttműködésének elmulasztása miatt az Egyesült Államok és Nagy-Britannia a diplomácia végét jelentette. 2003.március 17-én az amerikai Pres. George W., Bush elrendelte Szaddámnak, hogy mondjon le hivataláról és hagyja el Irakot 48 órán belül, vagy nézzen szembe a háborúval; azt is jelezte, hogy ha Szaddám elhagyja az országot, az amerikai erőkre szükség lehet az új kormány stabilizálásához és tömegpusztító fegyverek kereséséhez. Amikor Szaddám nem volt hajlandó távozni, az amerikai és a szövetséges erők március 20-án támadást indítottak Irak ellen.,
az iraki háború nyitó salvója az Egyesült Államok támadása volt., repülőgép egy bunkerkomplexumon, amelyben Szaddámról azt hitték, hogy alárendeltekkel találkozik. Bár a támadás nem ölte meg az iraki vezetőt, a Szaddám elleni későbbi támadások világossá tették, hogy az invázió fő célja az ő megszüntetése. Szaddám mindig makacsul hangoztatva arra buzdította az irakiakat, hogy állítsák le az életüket, hogy megállítsák az amerikai és brit erőket, de az invázióval szembeni ellenállás hamarosan összeomlott, és április 9-én, amikor Bagdad Az Amerikai katonákra esett, Szaddám bujkálni kezdett. Magával vitte a nemzeti kincstár nagy részét, és kezdetben képes volt elkerülni az amerikai csapatok elfogását., Fiait, Udayt és Qusayt július 22-én Moszulban elfogták és megölték, de csak December 13-án fogták el Szaddamot. Az egykor dapper vezért egy kis földalatti rejtekhelyről, tikrīt közelében, egy parasztház közelében húzták ki, kócosan és piszkosan. Bár fegyvere volt, Szaddám lövés nélkül megadta magát az amerikai katonáknak.