Battaglia di Manassas
Nel mese di luglio 1861 l’invasione di Virginia Federale truppe dell’esercito cominciò, e Jackson brigata si trasferì con altri di Johnston esercito per unirsi Generale P. G. T. Beauregard sul campo di Bull Run, in tempo per incontrare l’anticipo del Generale Irvin McDowell dell’esercito Federale. Fu qui che stazionò la sua brigata in una linea forte, trattenendo il nemico contro le probabilità schiaccianti e guadagnandosi il soprannome di “Stonewall.,”La primavera del 1862 trovò Jackson di nuovo nella valle dello Shenandoah, dove le sue tattiche diversive impedirono l’invio di rinforzi al generale dell’esercito federale George B. McClellan, che stava conducendo la campagna peninsulare contro Richmond, la capitale confederata. La strategia di Jackson probabilmente ha rappresentato la vittoria di Lee più tardi nelle battaglie dei Sette Giorni. Lee, allora capo consigliere militare del presidente confederato Jefferson Davis, suggerì a Jackson di usare le sue truppe per attaccare le truppe federali nella valle e quindi minacciare Washington., Con un rapido movimento, Jackson chiuse separatamente con diverse unità federali e le sconfisse. In aprile colpì le montagne della Virginia occidentale; poi il 24-25 maggio si rivolse al generale Nathaniel P. Banks e lo cacciò da Winchester e tornò al fiume Potomac.
Ha poi rapidamente rivolto la sua attenzione verso l’estremità meridionale della valle, sconfiggendo i federali a Cross Keys, Virginia, l ‘ 8 giugno, e a Port Republic il giorno successivo. Lee poi portò le truppe di Jackson su strada e ferrovia a Richmond per avvolgere l’ala destra dell’esercito di McClellan., Ma Jackson arrivò con un giorno di ritardo, e la sua reputazione perse parte del suo lustro, forse a causa della sua mancanza di esperienza in azioni su larga scala; tuttavia, McClellan fu respinto e gli fu ordinato di evacuare la penisola.
Lee si unì immediatamente a Jackson contro le forze federali che si raggruppavano sotto il generale John Pope. Mandò Jackson, con un ampio movimento di accerchiamento, ad attaccare la parte posteriore delle forze di Pope e portare alla Seconda battaglia di Bull Run, in cui Pope fu sonoramente battuto. Lee ha poi attraversato il Potomac per la “liberazione” del Maryland., Per proteggere Richmond, Lee distaccò Jackson per catturare Harpers Ferry, cosa che fece in tempo (13-15 settembre) per ricongiungersi a Lee ad Antietam. Dopo il suo ritorno in Virginia, Lee divise il suo esercito in due corpi, il generale James Longstreet al comando del primo e Jackson, ora tenente generale, il secondo. A Fredericksburg, Virginia, nel mese di dicembre, Jackson era al comando della destra confederata quando attacco avventato del generale federale Ambrose E. Burnside è stato facilmente respinto ed è stato schiacciante sconfitto.,
In aprile, il generale Joseph Hooker, successore di Burnside, tentò di trasformare la posizione confederata sul fiume Rappahannock, a sud di Washington. Lì la squadra apparentemente invincibile di Lee e Jackson ha fatto la sua mossa più audace. Lasciando un piccolo distaccamento per incontrare le truppe federali sul Rappahannock, Lee spostò il suo corpo principale, incluso il corpo di Jackson, per incontrare l’involucro minacciato di Hooker nei boschi di Chancellorsville., Quindi divise di nuovo il suo esercito, mantenendo solo 10.000 uomini per manifestare contro il fronte di Hooker, e mandò Jackson a muoversi segretamente intorno al diritto di Hooker con tutto il suo corpo.