A false-color 전송 전자현미경 사진의 여러 박테리오파지에 연결된 세균 셀 벽입니다. 신용:허
새로운 유전자 접근 방식을 가속할 수 있는 연구의 살균-미생물 상호작용 영향을 미칠 수 있는 건강,농업,그리고 기후입니다.
과학자들은 지속적으로 찾고 새롭고 향상 방법과 거래하는 박테리아,그것을 제거하는 질병 일으키는 원인이 되는 균이나 수정을 잠재적으로 유리한 종자., 에도 불구하고 수많은 영리한 약물과 유전자 엔지니어링 도구는 인류가 발명한 이러한 작업,그 접근 방식 보일 수 있는 서른에 비해 정밀하게 튜닝 공격에 의해 벌어 페이지–바이러스를 감염시키는 박테리아.
페이지,다른 기생충,지속적으로 진화하는 방법을 대상으로 악용들이 특정 호스트 세균성 변형,그리고 차례차례로,박테리아는 지속적으로 진화하는 뜻을 피하기 위해 페이지., 이러한 영구 전투 생존을 위해 수확량이 매우 다양한 분자 무기고 있는 연구자들은 가려움증을 공부하는,아직 이렇게 지루한 수 있습하고 노동 집약적입니다.
에 대한 통찰력을 얻기 위해 이 방어적인 전략을 이끄는 팀에 의해 버클리 실험실 과학자들은 단지 개발하고 효율적이며 저렴한 새로운 방법입니다. 보고서 PLOS 생물학,팀 보여주는 세 가지의 조합 기술을 밝힐 수 있는 세균성 수용체 페이지 이용에 감염뿐만 아니라,셀 것 셀룰러 메커니즘 박테리아 대응하기 위한 살균 감염.,
“에도 불구하고 거의 한 세기 분자의 작업이,기본 메커니즘의 파지-호스트의 상호 작용은 알려진 몇 쌍,호스트가 잘 공부하게 생각될 수 있는 배양한 실험실에서,”사이 해당 저자 Vivek Mutalik,연구에서 버클리 실험실의 유전체학 및 환경시스템공학전공(EGSB)Division. “그러나,페이지를 나타내는 가장 풍부한 생물체에서 땅으로 인해 그들의 영향에서 박테리아,그들은 키 드라이버 환경에 영양을 주기,농산물,그리고 인간 및 동물의 건강이다., 긴급하게 되었을 얻을 더 기초 지식의 이러한 상호 작용을 더 잘 이해하기 위해서는 행성의 microbiomes 과를 개발하는 새로운 의약품과 같은 박테리아 기반 백신 또는 파지 칵테일을 치료하는 항생제 내성 감염.”
에 빛을 빛나는”dark matter”
팀의 세 갈래의 접근 방식이라고,바코드 기능 손실과 이익의 함수 라이브러리를 사용하여 설립된 기술을 만드는 유전자 삭제하고 또한 증가하는 유전자 발현을 식별하는 유전자의 박테리아를 사용해를 회피하기 페이지., 이 정보는 또한 파지의 게놈을 분석 할 필요없이 파지가 목표로하는 수용체를 과학자들에게 알려줍니다. (그러나 과학자들은 계획에 적응 기술에 사용하기 위해 바이러스에,미래에 대해 더 알아 봅니다.)
Mutalik 및 그의 동료 테스트들의 방법에는 두 종자 대장균의하는 것으로 알려진의 대상이 될 14 일 유전으로 다양한 페이지., 그들의 결과 확인 방법을 원활하게 작동하여 신속하게 드러내는 동일한 세트의 파지 수용체되었던 이전에 확인을 통해 수십 년 동안 연구하고,또한 제공하고 새로운타 누락된 이전 연구에서.
파지의 예술적 렌더링. 신용:Antara Mutalik
에 따르면 Mutalik,의 접근을 확장할 수도 있습을 동시에 평가하는 파지는 관계의 수백을 위해 박테리아 샘플링에서 다양한 환경입니다., 이 훨씬 더 쉽게 만들 것입니다에 대한 과학자들을 연구하는 행성의 생물학적”dark matter,”참조하는 unculturable 따라서 제대로 이해된 미생물이 풍부에서 많은 환경입니다. 실제로 모든 살아있는 미생물의 99%가 실험실에서 배양 될 수 없다고 추정됩니다.
팀의 접근법도를 나타내는 기회를 표준화 유전소에 사용되는 벳바게 연구하고 있었습 ad-hoc 고 높은 변수 과정을 만들고 공유 가능 시약과 데이터 집합입니다.,
“역할 페이지의 거대한’로 알려진-는 아직 알려지지 않았지만 우리가 알고 있는 페이지 어디에나 있지만,거의 아무것도 알 더 있습니다. 예를 들어,우리는 이전에 서열화 된 파지 게놈에서 암호화 된 유전자의 10%미만을 이해한다”고 Mutalik 은 말했다. “이제는 우리가 마지막으로 간소화 된 도구를 보면서 페이지가 있는 많은 흥미로운 질문을 시작할 수 있습니다 우리가 대답하고 만들 수있는 기회를 세계에서 차이.,”
이 작품에 의해 주도되었 Mutalik 와 동료 EGSB 과학자들은 아담느 날,아버지와 아담 Deutschbauer 버클리에서 실험실에서의 연구자들과 UC 버클리에서 그리고 주립대학교 등이 있습니다. 이 연구는 Innovative Genomics Institute 의 미생물학 프로그램과 Berkeley Lab 이 주도하고 DOE 의 Office Of Science 가 지원하는 Scientific Focus Area 프로그램 인 ENIGMA 에 의해 자금을 지원 받았습니다.
