På død av sin far, Keiseren Huayna Evnen, og deres eldre bror, Ninan Cuyochi, som hadde vært arving, og riket ble delt mellom de to gjenlevende brødre, Huáscar og Atahualpa. Huascar fikk stor del av det med den hovedstad Cusco, og Atahualpa de nordlige deler, inkludert Quito (nå hovedstaden i Ecuador). For et par år, to brødre som regjerte uten problemer. Men Huascar krevde at Atahuallpa sverge en ed til ham. Atahuallpa nektet, og borgerkrigen begynte.,
Keiser Atahuallpa under Slaget i Cajamarca
Det endelige slaget fant sted på Quipaipan, hvor Huascar ble tatt til fange. Atahuallpa ble stående i byen Cajamarca i Andesfjellene med sin hær på 80.000 soldater på vei til sør-og Cusco til å kreve sin trone.
på denne tiden den spanske conquistador Francisco Pizarro hadde etablert byen Piura, den første spanske oppgjør i Peru på juli 1532., Etter to måneder på mars, Pizarro hadde kommet til Cajamarca med bare 168 menn under hans kommando og sendt Hernando de Soto, munken Vicente de Valverde og native tolk Felipillo å snakke med Atahuallpa om den spanske tilstedeværelse.
Den spanske utsendinger kom tilbake til Pizarro, som har forberedt en overraskelse angrep mot Atahuallpa hæren i det som ble Slaget i Cajamarca 16. November 1532.
i Henhold til spansk lov spansk offisielt erklært krig mot Inca folk., Når Atahuallpa kaldt spurte presten Valverde av hvilken myndighet han og hans folk kunne si slike ting, Valverde tilbød ham en Bibel, og sa at den myndighet som kom fra ord i den. Han undersøkte det og så spurte hvorfor det ikke tale til ham. Han kastet den i bakken. Som ga Spanjolene den unnskyldning de trengte for å føre krig på Inkaene. De åpnet ild, og i løpet av 2 timer mer enn to tusen Inca soldater ble drept. Den spanske deretter fengslet Atahuallpa i Temple of the Sun.,
Spanjolene utfører Tupac Amaru i 1572, tegning av Guaman Poma de Ayala
Atahuallpa kan fortsatt ikke tro det spanske ment å ta kontroll over hans rike. Han tenkte at hvis han ga dem gull og sølv som de søkte de måtte forlate. I bytte for hans løslatelse, gikk han med på å fylle et stort rom med gull og lovet den spanske to ganger dette beløpet i sølv., Selv om han ble overrasket av tilbudet, Pizarro hadde ingen intensjon om å slippe Inca fordi han trengte hersker innflytelse over de innfødte folk til å holde orden i de omkringliggende land.
Men så Pizarro bestemte seg for å ha ham henrettet fordi han fryktet at han kunne bli frigjort ved en Inka Generelt. Pizarro iscenesatt en mock trial og funnet Atahuallpa skyldig i opprør mot den spanske og myrdet Huáscar, hans egen bror. Atahuallpa ble dømt til gjennomføring av brenning., Han var forferdet, siden Inca trodde at sjelen ikke ville være i stand til å gå på stranden om kroppen ble brent. Munken Vicente de Valverde, som tidligere hadde tilbudt Bibelen til Atahuallpa, grep inn igjen, forteller Atahuallpa at hvis han sa ja til å konvertere til Kristendommen, han ville overbevise resten å pendle setningen. Atahualpa samtykket i å bli døpt inn i den Kristne tro. Han ble gitt navnet Juan Santos Atahualpa og deretter ble kvalt med et garrote i stedet for å bli brent. Atahuallpa døde på August 29, 1533.,Atahuallpa ble etterfulgt av sin bror, marionett Inca Tupac Huallpa, og senere av en annen bror Manco Inca Yupanqui.