testene’ kostnaden er ofte en uoverstigelig barriere: Forsikring selskapene i USA ikke rutinemessig nødt til å betale for dem, fordi, som de sier, resultatene ikke endrer autisme omsorg., «er svært variabel, avhengig av den politikken de har, selskapet og hvor mye tid jeg kan bruke på å snakke til en person som leser en datamaskin skjermen til meg på telefonen,» sier Joseph Cubells, professor i human genetikk og psykiatri ved Emory University i Atlanta, Georgia. «Det er svært begrenset og frustrerende.»
Rutine microarray testing ville ha spart Calleen Kenney år av bekymring og skyld hadde det vært tilgjengelig når hennes datter Maia ble født 20 år siden., Når Maia var 2, leger testet henne for et par kjente tilstander forbundet med autisme, inkludert skjøre X og Angelman syndromer. Kenney tolket negative resultater som betyr at Maia at tilstanden ikke var genetisk. Selv når leger bemerket at Maia har forskjellige ansiktstrekk som signal en genetisk tilstand, Kenney trodde de var bare kritisere hennes datter utseende. Når Maia ble diagnostisert med autisme omtrent et år senere, Kenney begynte å stille spørsmål ved alt hun hadde gjort, fra vaccinating Maia til ting hun hadde spist når hun var gravid.,
Det var først i oktober, da Maia hadde til slutt en kromosomale microarray analyse, som Kenney lært datteren hennes har en sletting av en genetisk regionen kalt 22q13. Slettingen fører til Phelan-McDermid syndrom, en tilstand som Maia hadde aldri blitt testet for. Syndromet, ofte ledsaget av autisme, kan påvirke nyrene og øyne, og Kenney umiddelbart tenkte på Maia ‘s pågående problemer med vannlating og hennes blokkert rive kanaler; hun har siden sørget for å ha Maia’ s nyrer og øyne kontrolleres regelmessig.
Kenney også sluttet å skylde på seg selv og prøver å endre hennes datter., Maia har blitt mer engstelig over tid og er livredd for å gjøre noe på egen hånd. Før testen, Kenney hadde prøvd å lære Maia å bli mer selvstendig, noe som bare gjorde Maia mer engstelige og sint. Men nå, erkjenner at Maia er måten hun er på grunn av biologi, Kenney har leid inn ekstra vaktmester for å sørge for at Maia har alltid hjelpe.
«i Stedet for å prøve å endre sin atferd, kan vi endre hvordan vi tar vare på henne,» Kenney sier. «Det har gitt meg en masse av lettelse å vite hvor hennes autisme kommer fra, og at det ikke var noe jeg kunne ha gjort annerledes.,»
Gen av gene:
Maia ‘ s tilstand er en av bare et par forbundet med autisme som er forårsaket av store kromosomale mutasjoner. I mange andre tilfeller, mutasjon i konflikt med et enkelt gen—og det kan være hundrevis av disse genene, i henhold til de nyeste anslaget. Men genet paneler mange kommersielle laboratorier bruke inkluderer noen gener fra denne listen, i stedet for å favorisere de som er forbundet med kjente syndromer. En studie i fjor fant at genet lister fra 21 selskaper har bare ett gen i vanlig; bare 12 inkludert CHD8, ofte sitert som en topp autisme genet.,
«Det finnes ingen klare kriterier for tildeling av et gen til en autisme-listen, de fleste av selskapene ikke gi en begrunnelse for inkludering, sier co-lead researcher Ny Hoang, en genetisk rådgiver ved Hospital for Sick Children i Toronto, Canada. Hoang og hennes kolleger er en del av en internasjonal arbeidsgruppe for å sette sammen en liste av gener som har sterke kliniske bånd til autisme. De har som mål å gjøre listen, og et sett av retningslinjer som er offentlig tilgjengelig og til å oppdatere både regelmessig.,
til Slutt, genetiske tester kan omfatte sekvensering folk hele genomer: Forberedende arbeid presentert på en genetikk konferanse i oktober tyder på at ville være den mest effektive første-linje-metoden, som det ville oppdage alle opplysninger fra hver type genetisk test. I mellomtiden, noen avanserte-sentre, inkludert forskning labs, har tilgang til verktøy som kan sekvens exome—samling av all den protein-kodende segmenter i et genom. Denne metoden er kostbar, og den lange listen av resultatene det genererer kan gjøre det utfordrende å finne mutasjonen ansvarlig., Men det kan også avdekke uventede mutasjoner.
Carbone måtte be to ganger at James’ exome bli sekvensert—det tok to år før forsikringsselskapet avtalt. I juli, en måned før resultatene kom, 15-år gamle James hadde kirurgi for å rekonstruere en åpning til hans bihulene. Etter inngrepet, han ble utskrevet og sendt hjem. Men da han begynte å blø. Han besvimte på grunn av blodtap, og Angela holdt ham oppreist, som utløste kramper. Da han våknet, livredd, James kjempet ambulansepersonellet som de prøvde å ta ham tilbake til sykehuset.,
En måned senere, den exome sekvens åpenbart at James har to viktige mutasjoner: den ene i TAF1, noe som forklarer hans autisme og utviklingsmål forsinkelse, og én i genet GP9 som fører til at hans lave blodplater og førte til komplikasjoner etter operasjonen.
Utover fordeler for den enkelte, sekvensering exomes kan være den eneste måten forskere kan avdekke den fulle listen av mutasjoner knyttet til autisme. Med dette målet i tankene, John Constantino ‘ s team tilbyr exome sekvensering til alle som besøker deres autisme klinikk ved Washington University i St. Louis, Missouri., Teamet tester hvert individ med en microarray først, og deretter gjør saken for exome sekvensering for å kvalifisere seg for forsikring refusjon. De samarbeider med en kommersiell lab som forhandler på refusjoner og bruke en egen bevilgning for å absorbere noe forsikringen ikke dekker. «Det er en av disse latterlig tragedier i form av en ikke-systematisk helse-systemet som vi selv arbeider med dette; det er som byttemiddel eller noe,» Constantino sier.,
Constantino og hans samarbeidspartnere har identifisert genetiske varianter som disponerer autistiske mennesker til undergrupper av epilepsi som svarer til bestemte stoffer. Resultatene har også endret behandling for noen autistiske mennesker basert på kasuistikker av andre med samme mutasjon. Og i ett tilfelle, team funnet en mutasjon knyttet til autisme i en udiagnostisert barn. Barnet hadde vist aggressiv atferd i det offentlige, og hadde blitt tatt fra sine foreldre ved Child Protective Services; han ble forent med sin familie etter at han fikk diagnosen.,
Ledbetter gruppe på Geisinger tilbyr også genetiske tester til hver person med autisme eller forsinket utvikling. De var i stand til å overbevise sine inngått et forsikringsselskap som exome sekvensering bør være første-linje test fordi den kan oppdage store mutasjoner normalt bare identifisert ved microarrays.
Begge disse gruppene opprettholde uavhengige lister av mutasjoner og deres tilknyttede kliniske effekter. Gjennomsnittlig kliniker, men kan ikke være klar over disse ressursene, eller vet hvordan å bruke dem.,
Det er noen databaser som er tilgjengelig for alle kliniker som trenger å slå opp betydningen av en bestemt mutasjon. ClinVar og ClinGen, som er finansiert av National Institutes of Health, liste gener og spesifikke varianter som blir funnet hos personer med kjent forhold. ClinGen, for eksempel lister over 40 gener med en ‘endelig’ link til autisme. Profesjonelle organisasjoner anbefaler klinikere til å søke både ClinVar og ClinGen, så vel som store databaser av kontroller. De anbefaler også å vurdere om mutasjonen er sannsynlig å forstyrre relatert protein., Resultatet er et samlet resultat av ‘patogene,’ ‘sannsynligvis patogene,’ ‘usikker betydning,’ ‘sannsynlig benign’ eller ‘godartet.’
Dette klassifiseringssystemet er et forsøk på å standardisere hvordan labs link gener og varianter til en tilstand, sier Christa Lese Martin, direktør for Autisme og Utviklingsmessige Medisin Institutt ved Geisinger. Mange laboratorier som rutinemessig omanalyserer alle sekvensene i deres database årlig for å se etter tidligere ukjente linker. Geisinger også opprettholder et gen ‘watch list»: I det siste året, for eksempel, har de oppgradert genet DLG4 fra «usikker» til » patogene,’ Martin sier., «Vi har lært mye ved å ha mer data.»
Geisinger personalet tilbyr exome sekvensering til alle som besøker deres helse klinikken og har testet mer enn 100 000 mennesker så langt. Fra en første gruppe av 60 000 mennesker, de som er identifisert 35 som har en sletting i en kromosom-segmentet kalt 16p11.2, som er knyttet til både autisme og fedme. Alle 35 er overvektig eller obese, men tidlig informasjon om mutasjon kan ha forhindret dette utfallet.
For mange autistiske mennesker og deres familier, informasjon tilbyr også kraftig lindring fra et liv med usikkerhet.,
«Det er en forvandlende personlig erfaring for disse menneskene som hadde lærevansker, slet på skolen og aldri forstått hvorfor, deres foreldre og lærere trodde de var late og ikke prøvde hardt, deres foreldre og lærere ikke tror de hadde angst lidelse; de hadde det de trodde var relatert fysiske medisinske problemer,» Ledbetter sier. «Vi tror det ville være langt bedre for folk å finne det ut i tidlig barndom.»
Siden James fikk en passende behandling for hans blødning tilstand, han har ikke hatt en eneste neseblødning., Hadde legene kjent om hans tilstand før, kunne de ha spart James traumer av å bli kjørt tilbake til sykehuset i ambulanse etter hans sinus kirurgi. James brukes til å smile og peker ivrig da han så ambulanser og brannbiler, men han nå roper ut, «Ingen ambulanse!»og «Ingen brannbilen!»Få ham til sykehuset selv for rutinemessig avtaler har blitt en utfordring.
For Angela, de genetiske resultatene endte år med venting., Noe av det hun har lært om virkninger av TAF1 mutasjon har vært tankevekkende, sier hun, men minst hun endelig vet roten av James’ forhold og kan planlegge for fremtiden. «Det er sorg, er det endelig aksept,» sier hun. «Jeg er takknemlig for at jeg vet.,»
MER å LESE
- Studier styrker autisme er nysgjerrig link til kjønn varians
- for å Nå ut til familier kan inspirere nye autism research
- Genetisk testing for autisme
- Spektrum Historier: Trykke intelligens i minimalt verbale mennesker med autisme
Denne historien ble opprinnelig publisert på Spektrum.
