proteinkinaser är viktiga regulatorer av cellfunktion som utgör en av de största och mest funktionellt olika genfamiljerna. Genom att tillsätta fosfatgrupper till substratproteiner leder de aktiviteten, lokaliseringen och den övergripande funktionen hos många proteiner och tjänar till att orkestrera aktiviteten hos nästan alla cellulära processer. Kinaser är särskilt framträdande i signalomvandling och samordning av komplexa funktioner som cellcykeln., Mångfalden av väsentliga funktioner som förmedlas av kinaser visas genom bevarande av cirka 50 olika kinasfamiljer mellan jäst, ryggradslösa djur och däggdjurskinomer. Av de 518 humana proteinkinaserna hör 478 till en enda superfamilj vars katalytiska domäner är relaterade i följd. Dessa kan grupperas i grupper, familjer och underfamiljer, för att öka sekvensens likhet och biokemisk funktion., Kinasdendrogrammen (ovan) visar sekvensens likhet mellan dessa katalytiska domäner: avståndet längs grenarna mellan två kinaser är proportionellt mot divergensen mellan deras sekvenser. Sju stora grupper är märkta och färgade tydligt. Till exempel bildar tyrosinkinaserna en distinkt grupp, vars medlemmar fosforylatproteiner på tyrosinrester, medan enzymer i alla andra grupper fosforylat främst serin och treoninrester., De relationer som visas på trädet kan i vissa fall användas för att förutsäga proteinsubstrat och biologisk funktion för många av de över 100 okarakteriserade kinaserna som presenteras här. Ytterligare 40 ”atypiska” kinaser har ingen sekvens likhet med typiska kinaser, men är kända eller förutspås ha enzymatisk aktivitet, och vissa förväntas ha en liknande strukturell veck till typiska kinaser.
Gerard Bemanning, Sugen, Inc. I South San Francisco, CA, USA
