Battle of Manassas
i juli 1861 började invasionen av Virginia av federala arméstyrkor, och Jacksons brigad flyttade med andra av Johnstons armé för att förena sig med General P. G. T. Beauregard på fältet Bull Run i tid för att möta General Irvin McDowells federala armé. Det var här som han stationerade sin brigad i en stark linje, undanhöll fienden mot överväldigande odds och tjänade sobriquet ”Stonewall.,”Våren 1862 hittade Jackson igen i Shenandoah Valley, där hans avledande taktik förhindrade att förstärkningar skickades till Federal arméns general George B. McClellan, som förde peninsular-kampanjen mot Richmond, Confederate capital. Jacksons strategi stod möjligen för Lees seger senare i de sju dagars striderna. Lee, dåvarande chefen för militära rådgivare till Konfederationens president Jefferson Davis, föreslog att Jackson att han använder sina trupper för att attackera Federala trupper i dalen och därmed hota Washington., Genom snabb rörelse stängde Jackson separat med flera federala enheter och besegrade dem. I April slog han i bergen i västra Virginia; sedan maj 24-25 han vände på General Nathaniel P. Banks och körde honom ut ur Winchester och tillbaka till Potomac River.
han vände sedan snabbt sin uppmärksamhet mot den södra änden av dalen och besegrade Federalerna vid Cross Keys, Virginia, den 8 juni och vid Port Republic på nästa dag. Lee tog sedan Jacksons trupper på väg och järnväg till Richmond för att omsluta högerkanten av McClellans armé., Men Jackson kom en dag sent, och hans rykte förlorade en del av sin lyster, eventuellt på grund av hans brist på erfarenhet av storskaliga åtgärder; ändå blev McClellan slagen tillbaka och beordrades att evakuera halvön.
Lee gick genast med i Jackson mot de federala styrkorna som omgrupperade under General John Pope. Han skickade Jackson, genom en bred omslutande rörelse, för att attackera baksidan av påvens styrkor och ta på sig den andra slaget vid Bull Run, där påven blev ordentligt slagen. Lee korsade nästa Potomac för ”befrielsen” av Maryland., För att skydda Richmond, Lee frigjorde Jackson att fånga Harpers Ferry, som han gjorde i tid (September 13-15) för att återförenas Lee på Antietam. Efter sin återkomst till Virginia delade Lee sin armé i två kår, General James Longstreet befallande den första och Jackson, nu en generallöjtnant, den andra. Vid Fredericksburg, Virginia, i December, Jackson var i befäl över Konfederationen rätt när Federal general Ambrose E. Burnsides utslag attack var lätt avvisas och han krossande besegrades.,
i April försökte General Joseph Hooker, Burnsides efterträdare, vända Konfederationens position på Rappahannock River, söder om Washington. Där gjorde det till synes oövervinneliga laget Lee och Jackson sitt djärvaste drag. Efter att ha lämnat en liten avdelning för att möta federala trupper på Rappahannock flyttade Lee Sin huvudkropp, inklusive Jacksons kår, för att möta Hookers hotade kuvertering i Chancellorsvilles skog., Han delade sedan sin armé igen, med endast 10 000 män för att demonstrera mot Hooker ’s front, och han skickade Jackson att flytta hemligt runt Hooker’ s rätt med hela sin kår.