Den nåværende viktigste alternativ behandling tilnærming er kirurgisk reseksjon. Etter operasjonen, pasienter kan bruke opp til en uke på sykehuset, og kan ta opptil 6 måneder før de kan gå tilbake til normale aktiviteter. Noen ganger kirurgi krever forebyggende plassering av intern fiksering maskinvare, hvis reseksjon av en betydelig del av det omkringliggende benet forlater gjenværende bein svekket.,
Ved Stanford helsevern (tidligere Stanford Hospital & Klinikker), eksperter i MR veiledet høyintensitet fokusert ultralyd (MRgFUS eller MRgHIFU) tilbyr nå denne ikke-invasiv behandling som et alternativ til mer invasive RF ablasjon eller kirurgisk behandling av osteoid osteoma. Food and Drug Administration har godkjent MRgFUS for behandling av livmor fibroids, og av vonde bein metastaser. Ved hjelp av samme teknikk som for behandling av ondartede bein kreft, MRgFUS har også blitt brukt som en ikke-invasiv metode for å behandle osteoid osteomas., MRgFUS behandlingen utføres under generell, ryggmarg eller regional anestesi i poliklinisk, slik at pasienten til å vende hjem i ettermiddag etter behandling. Sammenlignet med radiofrekvens ablasjon, smertelindring etter MRgFUS er mer rask, oppstår i løpet av den første dagen etter inngrepet. Også, på grunn av den målrettede natur fokusert ultralyd terapi, omkringliggende vev er skadet, slik at pasienter for å gå tilbake til normale aktiviteter innen en uke etter behandling.,
Med MRgFUS behandling, MR brukes til å identifisere nidus av osteoid osteoma, etterfulgt av et par lave energi ultralyd behandlinger som krever et par minutter for å varme svulsten og ødelegge det. MR brukes til å bekrefte suksess av behandlingen på slutten av prosedyren. Bildene nedenfor er fra vellykket MRgFUS behandlinger ved Stanford. Venstre bilde viser en osteoid osteoma i den venstre leggen, i tibia, og det høyre bildet viser en osteoid osteoma i høyre fot, i den femte mellomfoten. Pasientenes smerte score redusert til null etter behandling.,