Sobre a morte de seu pai, o Imperador Huayna Capac, e seu irmão mais velho, Ninan Cuyochi, que tinha sido o herdeiro, o império foi dividido entre os dois sobreviventes irmãos Huáscar e Atahualpa. Huascar tem a maior parte dela com a capital, Cusco, e Atahualpa as partes do norte, inclusive em Quito, capital do Equador). Durante alguns anos, os dois irmãos reinaram sem problemas. Mas Huascar exigiu que Atahuallpa lhe fizesse um juramento. Atahuallpa recusou e a guerra civil começou.,
Imperador Atahuallpa durante a Batalha de Cajamarca
A batalha final aconteceu no Quipaipan, onde Huascar foi capturado. Atahuallpa estava descansando na cidade de Cajamarca, nos Andes, com seu exército de 80.000 soldados em seu caminho para o sul e Cusco para reivindicar seu trono. nesta época, o conquistador espanhol Francisco Pizarro tinha estabelecido a cidade de Piura, o primeiro assentamento espanhol no Peru em julho de 1532., Depois de dois meses na marcha, Pizarro chegou a Cajamarca com apenas 168 homens sob seu comando e enviou Hernando de Soto, Frei Vicente De Valverde e o intérprete nativo Felipillo para falar com Atahuallpa sobre a presença espanhola. os enviados espanhóis voltaram para Pizarro, que preparou um ataque surpresa contra o exército de Atahuallpa no que se tornou a batalha de Cajamarca em 16 de novembro de 1532.de acordo com a lei espanhola, os espanhóis declararam oficialmente guerra ao povo Inca., Quando Atahuallpa friamente perguntou ao sacerdote Valverde por que autoridade ele e seu povo poderiam dizer tais coisas, Valverde ofereceu – lhe uma Bíblia, dizendo que a autoridade veio das palavras nela. Ele examinou – o e depois perguntou por que não falou com ele. Depois atirou-o ao chão. Isso deu aos espanhóis a desculpa que precisavam para fazer guerra aos Incas. Eles abriram fogo, e ao longo de duas horas mais de dois mil soldados Inca foram mortos. Os espanhóis então aprisionaram Atahuallpa no Templo do sol.,
Espanhóis execução de Tupac Amaru, em 1572, de desenho por Guaman Poma de Ayala
Atahuallpa ainda não podia acreditar que o espanhol se pretende assumir o controle de seu reino. Ele pensou que se ele lhes desse o ouro e a prata que eles procuravam eles iriam embora. Em troca de sua libertação, ele concordou em encher uma grande sala com ouro e prometeu aos espanhóis o dobro dessa quantia em prata., Apesar de ter ficado surpreso com a oferta, Pizarro não tinha intenção de liberar os Inca porque ele precisava da influência do governante sobre os povos nativos para manter a ordem no país circundante.mas Pizarro decidiu executá-lo porque temia que pudesse ser libertado por um General Inca. Pizarro encenou um julgamento simulado e considerado Atahuallpa culpado de se revoltar contra os espanhóis e assassinar Huáscar, seu próprio irmão. Atahuallpa foi condenado à execução por queima., Ele ficou horrorizado, uma vez que os Inca acreditavam que a alma não seria capaz de ir para a vida após a morte se o corpo fosse queimado. Frei Vicente De Valverde, que havia anteriormente oferecido a Bíblia a Atahuallpa, interveio novamente, dizendo a Atahuallpa que se ele concordasse em se converter ao cristianismo, ele convenceria os outros a comutar a sentença. Atahualpa concordou em ser batizado na fé cristã. Foi-lhe dado o nome de Juan Santos Atahualpa e depois foi estrangulado com um garrote em vez de ser queimado. Atahuallpa morreu em 29 de agosto de 1533.,Atahuallpa foi sucedido por seu irmão, o fantoche Inca Tupac Huallpa, e mais tarde por outro irmão Manco Inca Yupanqui.
