upper basinEdit
as nascentes estão nas florestas da Nova Inglaterra/Acadiana de Maine e Quebec, incluindo os ramos sudoeste, noroeste e Baker, e o Rio Allagash fluindo para New Brunswick em Edmundston, onde é acompanhado pelo Rio Madawaska.
basinEdit médio
a secção média vai da confluência dos rios Aroostook e Tobique, fluindo para sudeste até à Barragem de Mactaquac. Outros afluentes desta seção incluem o Rio Meduxnekeag., Esta área é o único lugar no Canadá Atlântico onde a floresta de madeira de folhosas Apalaches é encontrada. Plantas raras para a província incluem gengibre selvagem, framboesa preta, café Selvagem, maidenhair fern, showy orchis e outros. Este tipo de floresta, também conhecida como floresta de madeira do Vale do Rio São João, já se espalhou por grande parte da área e foi reduzida a menos de um por cento da área por causa das atividades humanas. Esta é uma área de colinas ondulantes e solos que são os mais férteis e fortemente cultivados em New Brunswick., Os solos são finos, loamy, e as lamelas glaciais bem drenadas sobrepondo calcário e arenito.o clima aqui é mais seco e mais quente do que as regiões circundantes.
basinEdit inferior
a bacia inferior, 140 quilómetros até ao porto de Saint John na Baía de Fundy, consistindo em Lagos, Ilhas, zonas húmidas e um estuário de marés. Os afluentes desta secção incluem os rios Nashwaak e Nerepis e Belleisle Bay.o último afluente, o Rio Kennebecasis, é um fiorde com uma soleira, ou aumento de profundidade perto da Foz de um fiorde causado por uma morena terminal., A partir de Grand Bay, a via navegável torna-se mais estreita e mais profunda formando um desfiladeiro onde na inversão cai Maré de entrada força o fluxo de água para reverter contra a corrente predominante. Uma cunha de água salgada, abaixo de uma cobertura de superfície de água doce, estende-se rio acima até aos 10 metros de profundidade em Ponto de Carvalho para além do qual não pode avançar.
formação e hidrologia
a bacia de drenagem é de 55.000 quilômetros quadrados( 21.000 sq mi), dos quais 20.000 quilômetros quadrados (7.700 sq mi) é o Maine. A descarga média é de 1100 m3/s., O fluxo de água é mais baixo no outono, e consideravelmente mais elevado do que a média durante a primavera fresca a 6800 m3/s. No início da primavera, as secções superiores do rio podem experimentar geleiras causando inundações. Nas secções inferiores da planície aluvial mais ampla, as inundações podem ocorrer durante o final da primavera a partir do volume de água que deve fazer o seu caminho através do desfiladeiro estreito nas quedas de marcha atrás.legalmente, todo o rio a jusante de um ponto entre Fredericton e Mactaquac Provincial Park é considerado maré.,
O rio é principalmente calmo, exceto para cachoeiras em Grand Falls e na Barragem de Beechwood.
Floodedit
com o fluxo de água na primavera sendo seis vezes a taxa média, o vale sempre foi propenso a inundações na primavera. O escoamento superficial de chuvas fortes é a principal causa de enchentes, e pode ser exacerbado por geleiras, marés altas e neve rápida. As inundações têm sido documentadas há mais de 300 anos. Inundações ocorreram em Edmundston, Grand Falls, Perth-Andover, Hartland e Woodstock, e mais severamente em torno de Fredericton.,grandes inundações ocorreram em 1923, com água 8 metros acima da baixa normal do inverno. Em 1936, altas temperaturas aceleraram a neve, e chuvas fortes elevaram o nível da água para 8,9 metros, cerca de 7,6 metros acima do nível do verão. Circunstâncias semelhantes levaram ao mesmo nível de água elevada na inundação de 1973. Em 2008, o nível da água atingiu 8,36 em Fredericton. Inundações semelhantes ocorreram novamente em 2018.prevê-se que a gravidade e frequência das inundações aumentem com as alterações climáticas., Prevê-se que a temperatura média de New Brunswick aumente 5 C até ao ano 2100, e que a precipitação aumente.